携手Moderna与勃林格殷格翰,IBM重回医疗

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发布时间:2024-04-23 11:06

11月28日,勃林格殷格翰和IBM宣布达成一项合作协议,勃林格殷格翰将能够利用IBM的基础模型技术来发现新型候选抗体,用于开发有效的治疗方法。 

根据协议,勃林格殷格翰将使用IBM开发的预训练人工智能模型,该模型将根据勃林格殷格翰的其他专有数据进行进一步微调以生成目标候选抗体。 

勃林格殷格翰生物治疗药物研发全球主管Andrew Nixon表示,“双方合作将开发出一个前所未有的加速抗体发现的平台,加速公司创造新抗体疗法的步伐。”

建立在超11亿个分子基础上的MoLFormer

治疗性抗体是癌症、自身免疫性疾病和传染病等疾病治疗的核心,但是覆盖不同表位的治疗性抗体的发现和开发是一个高度复杂且耗时的过程。而人工智能(AI)和深度学习正在改变抗体药物研发的多个方面,其中,AI正在逐渐影响到更为复杂的层面——抗体的设计和优化。 

而此次勃林格殷格翰与IBM的合作将为其抗体研发装上“加速器”。在双方合作基础上,林格殷格翰和IBM研究人员将共同致力于通过IBM基础模型技术,提高抗体发现的速度和效率以及预测候选抗体的质量。 

勃林格殷格翰“信任”IBM的原因在于,IBM此前发布了一个能够有效筛选并生成新分子的模型——MoLFormer。 

MoLFormer是一种预训练的AI模型,它在2个公共化学数据库——PubChem(包含约1亿个分子)和ZINC(包含约10亿个分子)中,以自监督的方式预训练基于Transformer神经网络的模型,学习有效和低维的化学分子表征。而后通过对任务特定数据的微调,将模型以迁移学习的方式,应用于不同的下游分子性质预测任务、计算分子相似性,以及分析给定分子的原子间空间距离和注意力值之间的对应关系。 

简单来说,MoLFormer可以预测分子的物理特性(如溶解度)、生物物理特性(如抗病毒活性)、生理特性(如穿过血脑屏障的能力)以及量子特性(如分子的带隙能量)等。此外,MoLFormer还可用作解码器,生成具有所需特性的新设计的蛋白质和小分子。 

在实际研发中,IBM与其合作伙伴将形成一个循环通路。以勃林格殷格翰为例,首先,IBM通过MoLFormer等基础模型技术为勃林格殷格翰筛选出目标候选抗体;随后,在验证步骤中,勃林格殷格翰将小规模生产候选抗体,并通过实验评估该候选抗体。 

最后,实验室实验的结果将会被用来通过反馈回路来改进计算机模拟方法,然后IBM根据其提供的特定专有数据对预训练模型进行微调,最终提供具有所需属性的新设计的目标抗体。

弃疗2年后,凭AI和量子计算再战医疗

在勃林格殷格翰前,IBM已与克利夫兰诊所(Cleveland Clinic)和Moderna就医疗保健研究和生物医药研发方面达成了合作。 

2023年4月,IBM和Moderna签署了一份合作协议,双方将AI和量子计算纳入mRNA疗法的开发,以加速设计出具有最佳安全性与有效性的mRNA药物。 

根据协议,Moderna将参加IBM量子加速器项目和IBM量子网络,IBM将提供量子计算系统的访问权限以及Moderna所需的专业知识,以推动Moderna探索由量子技术驱动的生命科学领域的前沿应用。此外,Moderna还将使用MoLFormer来了解潜在mRNA 药物的特征,并设计一类新的疫苗和疗法。 

2023年3月,IBM和克利夫兰诊所正式公布在美国部署的医用量子计算机。安装在克利夫兰诊所的IBM Quantum System One将成为世界上第一台专门用于医疗保健研究的量子计算机,它将帮助克利夫兰诊所优化医疗保健的复杂系统并加速生物医学发现。 

此次部署建立在IBM和克利夫兰诊所此前达成的一项合作的基础上。2021年3月,IBM和克利夫兰诊所宣布了一项为期10年的合作计划,共同建立一个名为Discovery Accelerator的设施,旨在通过在混合云、AI和量子计算技术上使用高性能计算,从根本上推进医疗保健和生命科学领域的发现速度。  

通过Discovery Accelerator,研究人员计划使用先进的计算技术生成和分析数据,以帮助克利夫兰诊所的全球病原体研究和人类健康中心,在基因组学、单细胞转录组学、人口健康、临床应用以及化学和药物发现等领域开展研究工作。 

自安装量子计算机以来,克利夫兰诊所已经启动了9个量子计算项目,这些项目包括:开发量子计算管道,筛选和优化针对特定蛋白质的药物;改进非心脏手术后心血管风险的量子增强预测模型;应用人工智能搜索基因组测序结果和大型药物目标数据库,以寻找有效的现有药物,帮助阿尔茨海默氏症和其他疾病患者。 

不过,就在IBM宣布和克利夫兰诊所合作的前一个月,IBM正在考虑拆分旗下Watson Health业务。2022年1月,IBM将Watson Health出售给总部位于旧金山的投资基金Francisco Partner。 

Watson Health是IBM花数十亿美元在医疗保健领域打造的一个业务板块,它主要利用AI帮助医院、保险公司和制药商管理数据,并提供癌症治疗解决方案,以辅助全球各地的医生对患者进行诊治。 

“成为真正的AI医生”是IBM开发Watson Health的目标,IBM希望通过Watson Health制霸未来的医疗AI市场。在推出Watson Health之时,IBM放出了“人类将会被取代”的豪言,并大力鼓吹它能够应用于拥有丰富多样语言的医疗、金融、法律和学术界。时任IBM的CEO Virginia Rometty也表示,这是IBM的“登月计划”、是IBM的战略任务之一。 

但事与愿违,Watson Health没有成为“将给医学界带来革命性改变的旗舰性产品”,反而成为IBM进军AI医疗领域的败笔。 

“没有真正用上AI”成为Watson Health失败的核心原因之一,IBM并未将其在宣传中所强调的AI技术整合到Watson Health产品中。领导打造Watson团队的David Ferrucci博士曾表示,“Watson的设计功能是识别单词模式,预测问答游戏正确答案,它并不是一个可以用于商业领域的万能解答器,它很可能在二年级阅读理解测试中不及格。” 

作为IBM在AI医疗领域最早最大的尝试之一,Watson Health最终以失败告终。 

不过,IBM并没有“一蹶不振”,而是重整旗鼓再战AI医疗。 

这一次,IBM一改此前“单打独斗”的方式和理念,通过寻求医疗领域内具有超强实力和医学背景知识的合作伙伴布局AI医疗领域,利用自身的AI和量子计算技术赋能创新药企,帮助企业解决医疗保健和医药研发中棘手的问题和挑战。 

从克利夫兰诊所到勃林格殷格翰,IBM正在逐渐扩大其在医疗领域的商业版图。这一次,IBM能否成功在医疗领域占有一席之地,我们拭目以待!

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